ALYREF

ALYREF
التراكيب المتوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	3ULH
المعرفات
الأسماء المستعارة	ALYREF, ALY, ALY/REF, BEF, REF, THOC4, Aly/REF export factor
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 604171 HomoloGene: 134554 GeneCards: 10189
علم الوجود الجيني
الوظيفة الجزيئية	• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • ربط حمض نووي; • RNA binding;
المكونات الخلوية	• سيتوبلازم; • عصارة خلوية; • nuclear speck; • catalytic step 2 spliceosome; • غشاء; • transcription export complex; • exon-exon junction complex; • spliceosomal complex; • حويصلة خارج خلوية; • نواة; • بلازم نووي;
العمليات الحيوية	• regulation of DNA recombination; • mRNA splicing, via spliceosome; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA transport; • mRNA processing; • viral mRNA export from host cell nucleus; • mRNA export from nucleus; • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation; • osteoblast differentiation; • replication fork processing; • ‏GO:0022415 viral process; • mRNA 3'-end processing; • تضفير الآر أن إيه; • RNA export from nucleus; • ‏GO:0015915 نقل;
	المصادر:Amigo / QuickGO
أورثولوج
	Q86V81
	D3ZXH7
	‏NR_158770 NM_005782، ‏NR_158770
	‏XM_006247925 NM_001109602، ‏XM_006247925
	NP_005773
	‏XP_006247987، ‏XP_038942805، ‏NP_001381323 NP_001103072، ‏XP_006247987، ‏XP_038942805، ‏NP_001381323
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

ALYREF‏ (Aly/REF export factor) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين ALYREF في الإنسان.[1][2][3]

المراجع

"Human ALY/BEF gene Map position 17q25.3"، Chromosome Res، 8 (6): 562، يناير 2001، doi:10.1023/A:1009236126053، PMID 11032328.
"Entrez Gene: ALYREF Aly/REF export factor"، مؤرشف من الأصل في 7 مارس 2010.
"Entrez Gene: THOC4 THO complex 4"، مؤرشف من الأصل في 7 مارس 2010.

قراءة متعمقة

"ALY, a context-dependent coactivator of LEF-1 and AML-1, is required for TCRalpha enhancer function."، Genes Dev.، 11 (5): 640–53، 1997، doi:10.1101/gad.11.5.640، PMID 9119228.
"Mass spectrometry and EST-database searching allows characterization of the multi-protein spliceosome complex."، Nat. Genet.، 20 (1): 46–50، 1998، doi:10.1038/1700، PMID 9731529.
"Autoantibodies to transcriptional regulation proteins DEK and ALY in a patient with systemic lupus erythematosus."، Hum. Immunol.، 60 (1): 57–62، 1999، doi:10.1016/S0198-8859(98)00085-8، PMID 9952027.
"A human nuclear-localized chaperone that regulates dimerization, DNA binding, and transcriptional activity of bZIP proteins."، Mol. Cell، 4 (2): 219–28، 1999، doi:10.1016/S1097-2765(00)80369-X، PMID 10488337.
"The spliceosome deposits multiple proteins 20-24 nucleotides upstream of mRNA exon-exon junctions."، EMBO J.، 19 (24): 6860–9، 2001، doi:10.1093/emboj/19.24.6860، PMC 305905، PMID 11118221.
"Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex."، Science، 293 (5536): 1832–6، 2001، doi:10.1126/science.1062829، PMID 11546873.
"Pre-mRNA splicing and mRNA export linked by direct interactions between UAP56 and Aly."، Nature، 413 (6856): 644–7، 2001، doi:10.1038/35098106، PMID 11675789.
"Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon-exon junction complex."، EMBO J.، 20 (22): 6424–33، 2002، doi:10.1093/emboj/20.22.6424، PMC 125744، PMID 11707413.
"TREX is a conserved complex coupling transcription with messenger RNA export."، Nature، 417 (6886): 304–8، 2002، doi:10.1038/nature746، PMID 11979277.
"Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis."، RNA، 8 (4): 426–39، 2002، doi:10.1017/S1355838202021088، PMC 1370266، PMID 11991638.
"Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome."، Genome Res.، 12 (8): 1231–45، 2002، doi:10.1101/gr.473902، PMC 186633، PMID 12176931.
"ICP27 interacts with the RNA export factor Aly/REF to direct herpes simplex virus type 1 intronless mRNAs to the TAP export pathway."، J. Virol.، 76 (24): 12877–89، 2002، doi:10.1128/JVI.76.24.12877-12889.2002، PMC 136725، PMID 12438613.
"Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences."، Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.، 99 (26): 16899–903، 2003، doi:10.1073/pnas.242603899، PMC 139241، PMID 12477932.
"An evolutionarily conserved role for SRm160 in 3'-end processing that functions independently of exon junction complex formation."، J. Biol. Chem.، 278 (45): 44153–60، 2004، doi:10.1074/jbc.M306856200، PMID 12944400.
"Growth-regulated expression and G0-specific turnover of the mRNA that encodes URH49, a mammalian DExH/D box protein that is highly related to the mRNA export protein UAP56."، Nucleic Acids Res.، 32 (6): 1857–65، 2004، doi:10.1093/nar/gkh347، PMC 390356، PMID 15047853.
"The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)."، Genome Res.، 14 (10B): 2121–7، 2004، doi:10.1101/gr.2596504، PMC 528928، PMID 15489334.
"Identifying and quantifying in vivo methylation sites by heavy methyl SILAC."، Nat. Methods، 1 (2): 119–26، 2005، doi:10.1038/nmeth715، PMID 15782174.
"Recruitment of the human TREX complex to mRNA during splicing."، Genes Dev.، 19 (13): 1512–7، 2005، doi:10.1101/gad.1302205، PMC 1172058، PMID 15998806.
"ALY is a common coactivator of RUNX1 and c-Myb on the type B leukemogenic virus enhancer."، J. Virol.، 81 (7): 3503–13، 2007، doi:10.1128/JVI.02253-06، PMC 1866045، PMID 17229714.
"Regulation of mRNA export by the PI3 kinase/AKT signal transduction pathway."، Mol. Biol. Cell، 24 (8): 1208–21، 2013، doi:10.1091/mbc.E12-06-0450، PMC 3623641، PMID 23427269.

بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
بوابة طب
بوابة الكيمياء الحيوية

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[pmid11032328-1] "Human ALY/BEF gene Map position 17q25.3"، Chromosome Res، 8 (6): 562، يناير 2001، doi:10.1023/A:1009236126053، PMID 11032328.

[entrez-2] "Entrez Gene: ALYREF Aly/REF export factor"، مؤرشف من الأصل في 7 مارس 2010.

[entrez2-3] "Entrez Gene: THOC4 THO complex 4"، مؤرشف من الأصل في 7 مارس 2010.

التصنيفات الطبية	OMIM ID: 604171
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000512673, ENST00000504015, ENST00000505490, ENST00000511412