UPF1

UPF1
التراكيب المتوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	2GJK, 2GK6, 2GK7, 2IYK, 2WJV, 2WJY, 2XZO, 2XZP
المعرفات
الأسماء المستعارة	UPF1, H, NORF1, RENT1, pNORF1, smg-2, RNA helicase and ATPase, RNA helicase and ATPase, UTF
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 601430 MGI: MGI:107995 HomoloGene: 2185 GeneCards: 5976
علم الوجود الجيني
الوظيفة الجزيئية	• nucleotide binding; • ربط دي إن إي; • telomeric DNA binding; • ربط أيون الزنك; • chromatin binding; • ربط أيون فلزي; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • نشاط هيدرولاز; • ATP binding; • ‏GO:0008026 helicase activity; • RNA binding;
المكونات الخلوية	• عصارة خلوية; • أجسام P; • exon-exon junction complex; • supraspliceosomal complex; • بلازم نووي; • كروماتين; • سيتوبلازم; • نواة;
العمليات الحيوية	• regulation of translational termination; • telomere maintenance via semi-conservative replication; • positive regulation of mRNA catabolic process; • mRNA export from nucleus; • تنسخ الحمض النووي الريبي منقوص الأكسجين; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process; • cellular response to interleukin-1; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, endonucleolytic cleavage-dependent decay; • histone mRNA catabolic process; • dosage compensation by inactivation of X chromosome; • cellular response to lipopolysaccharide; • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization; • ‏GO:0100026 ترميم الدنا; • تفكك متوسط بلا معنى; • regulation of telomere maintenance; • cell cycle phase transition; • ‏GO:0022415 viral process;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
أورثولوج
	Q92900; A0A024R7L8
	Q9EPU0
	‏NM_001297549، ‏XM_017027105، ‏XM_017027106، ‏XM_047439191 NM_002911، ‏NM_001297549، ‏XM_017027105، ‏XM_017027106، ‏XM_047439191
	‏NM_030680، ‏XM_006509604، ‏XM_006509605 NM_001122829، ‏NM_030680، ‏XM_006509604، ‏XM_006509605
	‏NP_002902، ‏XP_016882594، ‏XP_016882595 NP_001284478، ‏NP_002902، ‏XP_016882594، ‏XP_016882595; NP_001284478.1
	‏NP_109605، ‏XP_006509667، ‏XP_006509668 NP_001116301، ‏NP_109605، ‏XP_006509667، ‏XP_006509668
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

UPF1‏ (UPF1, RNA helicase and ATPase) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين UPF1 في الإنسان.[1][2]

المراجع

"Cloning and characterization of HUPF1, a human homolog of the Saccharomyces cerevisiae nonsense mRNA-reducing UPF1 protein"، Nucleic Acids Res، 25 (4): 814–21، مارس 1997، doi:10.1093/nar/25.4.814، PMC 146496، PMID 9064659.
"Mammalian orthologues of a yeast regulator of nonsense transcript stability"، Proc Natl Acad Sci U S A، 93 (20): 10928–32، نوفمبر 1996، doi:10.1073/pnas.93.20.10928، PMC 38260، PMID 8855285.

قراءة متعمقة

"The double life of UPF1 in RNA and DNA stability pathways"، Cell Cycle، 5 (14): 1496–8، 2006، doi:10.4161/cc.5.14.3093، PMID 16861888.
"Analysis of the stimulatory factor of RNA polymerase II in the initiation and elongation complex"، J. Biol. Chem.، 259 (1): 608–11، 1984، PMID 6200476.
"Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. VI. The coding sequences of 80 new genes (KIAA0201-KIAA0280) deduced by analysis of cDNA clones from cell line KG-1 and brain"، DNA Res.، 3 (5): 321–9, 341–54، 1997، doi:10.1093/dnares/3.5.321، PMID 9039502.
"The surveillance complex interacts with the translation release factors to enhance termination and degrade aberrant mRNAs"، Genes Dev.، 12 (11): 1665–77، 1998، doi:10.1101/gad.12.11.1665، PMC 316864، PMID 9620853.
"SMG-2 Is a Phosphorylated Protein Required for mRNA Surveillance in Caenorhabditis elegans and Related to Upf1p of Yeast"، Mol. Cell. Biol.، 19 (9): 5943–51، 1999، PMC 84455، PMID 10454541.
"Characterization of the biochemical properties of the human Upf1 gene product that is involved in nonsense-mediated mRNA decay"، RNA، 6 (9): 1226–35، 2000، doi:10.1017/S1355838200000546، PMC 1369996، PMID 10999600.
"Novel Upf2p Orthologues Suggest a Functional Link between Translation Initiation and Nonsense Surveillance Complexes"، Mol. Cell. Biol.، 20 (23): 8944–57، 2000، doi:10.1128/MCB.20.23.8944-8957.2000، PMC 86549، PMID 11073994.
"Identification and Characterization of Human Orthologues to Saccharomyces cerevisiae Upf2 Protein and Upf3 Protein (Caenorhabditis elegans SMG-4)"، Mol. Cell. Biol.، 21 (1): 209–23، 2001، doi:10.1128/MCB.21.1.209-223.2001، PMC 88795، PMID 11113196.
"Human Upf proteins target an mRNA for nonsense-mediated decay when bound downstream of a termination codon"، Cell، 103 (7): 1121–31، 2001، doi:10.1016/S0092-8674(00)00214-2، PMID 11163187.
"Cloning of a novel phosphatidylinositol kinase-related kinase: characterization of the human SMG-1 RNA surveillance protein"، J. Biol. Chem.، 276 (25): 22709–14، 2001، doi:10.1074/jbc.C100144200، PMID 11331269.
"Human SMG-1, a novel phosphatidylinositol 3-kinase-related protein kinase, associates with components of the mRNA surveillance complex and is involved in the regulation of nonsense-mediated mRNA decay"، Genes Dev.، 15 (17): 2215–28، 2001، doi:10.1101/gad.913001، PMC 312771، PMID 11544179.
"Communication of the position of exon-exon junctions to the mRNA surveillance machinery by the protein RNPS1"، Science، 293 (5536): 1836–9، 2001، doi:10.1126/science.1062786، PMID 11546874.
"Identification of delta helicase as the bovine homolog of HUPF1: demonstration of an interaction with the third subunit of DNA polymerase delta"، Nucleic Acids Res.، 30 (10): 2232–43، 2002، doi:10.1093/nar/30.10.2232، PMC 115286، PMID 12000843.
"Separable roles for rent1/hUpf1 in altered splicing and decay of nonsense transcripts"، Science، 298 (5592): 419–22، 2002، doi:10.1126/science.1074428، PMID 12228722.
Lykke-Andersen J (2003)، "Identification of a Human Decapping Complex Associated with hUpf Proteins in Nonsense-Mediated Decay"، Mol. Cell. Biol.، 22 (23): 8114–21، doi:10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002، PMC 134073، PMID 12417715.
"Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences"، Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.، 99 (26): 16899–903، 2003، doi:10.1073/pnas.242603899، PMC 139241، PMID 12477932.
"Characterization of human Smg5/7a: A protein with similarities to Caenorhabditis elegans SMG5 and SMG7 that functions in the dephosphorylation of Upf1"، RNA، 9 (1): 77–87، 2003، doi:10.1261/rna.2137903، PMC 1370372، PMID 12554878.
"Complexes between the nonsense-mediated mRNA decay pathway factor human upf1 (up-frameshift protein 1) and essential nonsense-mediated mRNA decay factors in HeLa cells"، Biochem. J.، 373 (Pt 3): 775–83، 2003، doi:10.1042/BJ20021920، PMC 1223536، PMID 12723973.

بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
بوابة طب
بوابة الكيمياء الحيوية

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[pmid9064659-1] "Cloning and characterization of HUPF1, a human homolog of the Saccharomyces cerevisiae nonsense mRNA-reducing UPF1 protein"، Nucleic Acids Res، 25 (4): 814–21، مارس 1997، doi:10.1093/nar/25.4.814، PMC 146496، PMID 9064659.

[pmid8855285-2] "Mammalian orthologues of a yeast regulator of nonsense transcript stability"، Proc Natl Acad Sci U S A، 93 (20): 10928–32، نوفمبر 1996، doi:10.1073/pnas.93.20.10928، PMC 38260، PMID 8855285.

التصنيفات الطبية	OMIM ID: 601430
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000601981, ENST00000262803, ENST00000594243, ENST00000594504, ENST00000596842, ENST00000598209, ENST00000598471, ENST00000599848, ENST00000600012, ENST00000600310, ENST00000600689, ENST00000600868, ENST00000601689